Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Chaf1aQ9QWF0 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Chaf1aQ9QWF0 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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