Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
CtsmQ9JL96 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
CtsmQ9JL96 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms