Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gde1Q9JL56 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gde1Q9JL56 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gde1Q9JL56 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gde1Q9JL56 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Gde1Q9JL56 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms