Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Chrac1Q9JKP8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Chrac1Q9JKP8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms