Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Scamp5Q9JKD3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Scamp5Q9JKD3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms