Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Csnk1dQ9DC28 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Csnk1dQ9DC28 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Csnk1dQ9DC28 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Csnk1dQ9DC28 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1dQ9DC28 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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