Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY1

Syvn1, E3 ubiquitin-protein ligase synoviolin, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syvn1Q9DBY1 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Syvn1Q9DBY1 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Syvn1Q9DBY1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Syvn1Q9DBY1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syvn1Q9DBY1 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syvn1Q9DBY1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syvn1Q9DBY1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syvn1Q9DBY1 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syvn1Q9DBY1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Syvn1Q9DBY1 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms