Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm12051-201ENSMUST00000147771 1341 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 C430019N01Rik-201ENSMUST00000199517 1567 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Tgif1-210ENSMUST00000172229 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Homer1-211ENSMUST00000109498 815 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 4930440I19Rik-201ENSMUST00000144728 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm6536-201ENSMUST00000171180 615 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm29416-202ENSMUST00000191328 1201 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr1075-ps1-201ENSMUST00000214201 470 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr1224-ps1-201ENSMUST00000099792 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr1224-ps1-202ENSMUST00000099793 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm32284-201ENSMUST00000213704 1484 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Hmgn2-203ENSMUST00000102553 1265 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Tpt1-ps5-201ENSMUST00000112150 516 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr762-ps1-201ENSMUST00000172948 927 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 1110008L16Rik-206ENSMUST00000184980 888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 1700010J16Rik-202ENSMUST00000189116 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Olfr779-202ENSMUST00000222301 929 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riok3Q9DBU3 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms