Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
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Ccdc97Q9DBT3 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc97Q9DBT3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ccdc97Q9DBT3 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
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