Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Smg9Q9DB90 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Smg9Q9DB90 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
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Smg9Q9DB90 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Smg9Q9DB90 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Smg9Q9DB90 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Smg9Q9DB90 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Smg9Q9DB90 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Smg9Q9DB90 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Smg9Q9DB90 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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