Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

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Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Tmem239Q9DA47 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Tmem239Q9DA47 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms