Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smco2Q9DA21 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smco2Q9DA21 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms