Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Chmp4cQ9D7F7 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chmp4cQ9D7F7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms