Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Q9D7E4 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Q9D7E4 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms