Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Cux1-204ENSMUST00000175975 10945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms