Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gcc1Q9D4H2 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gcc1Q9D4H2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms