Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zbed3Q9D0L1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Zbed3Q9D0L1 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbed3Q9D0L1 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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