Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtf2e1Q9D0D5 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms