Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc47Q9D024 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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