Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Utp23Q9CX11 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms