Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Rpusd4Q9CWX4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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