Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSH3

Dis3, Exosome complex exonuclease RRP44, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dis3Q9CSH3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Dis3Q9CSH3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Dis3Q9CSH3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms