Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ndufb9Q9CQJ8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ndufb9Q9CQJ8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms