Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efcab2Q9CQ46 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efcab2Q9CQ46 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efcab2Q9CQ46 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efcab2Q9CQ46 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Efcab2Q9CQ46 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Efcab2Q9CQ46 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Efcab2Q9CQ46 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Efcab2Q9CQ46 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Efcab2Q9CQ46 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Efcab2Q9CQ46 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Efcab2Q9CQ46 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Efcab2Q9CQ46 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms