Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Rnaseh2cQ9CQ18 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Rnaseh2cQ9CQ18 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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