Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tdrd1Q99MV1 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tdrd1Q99MV1 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms