Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Smim11aQ99J19 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Smim11aQ99J19 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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