Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc8b1Q925Q3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms