Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Cldn16Q925N4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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