Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Slc6a20aQ8VDB9 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
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