Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCQ6

Sgms1, Phosphatidylcholine:ceramide cholinephosphotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sgms1Q8VCQ6 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Sgms1Q8VCQ6 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Sgms1Q8VCQ6 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgms1Q8VCQ6 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgms1Q8VCQ6 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgms1Q8VCQ6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgms1Q8VCQ6 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgms1Q8VCQ6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgms1Q8VCQ6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgms1Q8VCQ6 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgms1Q8VCQ6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgms1Q8VCQ6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Sgms1Q8VCQ6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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