Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1mtQ8R4U6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Top1mtQ8R4U6 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Top1mtQ8R4U6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Top1mtQ8R4U6 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Top1mtQ8R4U6 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Top1mtQ8R4U6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Top1mtQ8R4U6 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Top1mtQ8R4U6 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Top1mtQ8R4U6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Top1mtQ8R4U6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Top1mtQ8R4U6 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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