Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0K9

E2f4, Transcription factor E2F4, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f4Q8R0K9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
E2f4Q8R0K9 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.05■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.05■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.05■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.04■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.04■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
E2f4Q8R0K9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms