Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
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Lrif1Q8CDD9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Lrif1Q8CDD9 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Lrif1Q8CDD9 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Lrif1Q8CDD9 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Lrif1Q8CDD9 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Lrif1Q8CDD9 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Lrif1Q8CDD9 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Lrif1Q8CDD9 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Lrif1Q8CDD9 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Lrif1Q8CDD9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Lrif1Q8CDD9 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lrif1Q8CDD9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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