Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBF3

Ephb1, Ephrin type-B receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb1Q8CBF3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Ephb1Q8CBF3 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ephb1Q8CBF3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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