Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5U0

4933409G03Rik, RIKEN cDNA 4933409G03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933409G03RikQ8C5U0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
4933409G03RikQ8C5U0 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
4933409G03RikQ8C5U0 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms