Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Q4

Nek11, Serine/threonine-protein kinase Nek11, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek11Q8C0Q4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Nek11Q8C0Q4 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nek11Q8C0Q4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nek11Q8C0Q4 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nek11Q8C0Q4 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nek11Q8C0Q4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nek11Q8C0Q4 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nek11Q8C0Q4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nek11Q8C0Q4 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Nek11Q8C0Q4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Nek11Q8C0Q4 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nek11Q8C0Q4 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms