Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Ctdsp2Q8BX07 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Ctdsp2Q8BX07 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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