Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
H2-M10.4Q85ZW8 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
H2-M10.4Q85ZW8 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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