Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc50Q810U5 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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