Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccdc172Q810N9 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms