Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ChfrQ810L3 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ChfrQ810L3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms