Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI6

Lrsam1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, mousemouse

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Length 727 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrsam1Q80ZI6 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lrsam1Q80ZI6 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrsam1Q80ZI6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrsam1Q80ZI6 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrsam1Q80ZI6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrsam1Q80ZI6 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrsam1Q80ZI6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lrsam1Q80ZI6 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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