Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ttc28Q80XJ3 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ttc28Q80XJ3 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
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Ttc28Q80XJ3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Ttc28Q80XJ3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms