Protein–RNA interactions for Protein: Q80VW7

Akna, AT-hook-containing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AknaQ80VW7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 AC124457.1-201ENSMUST00000198845 120 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AknaQ80VW7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms