Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Avl9Q80U56 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Avl9Q80U56 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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