Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
NischQ80TM9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
NischQ80TM9 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
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