Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

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Length 960 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ctdp1Q7TSG2 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ctdp1Q7TSG2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ctdp1Q7TSG2 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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