Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Actn1Q7TPR4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms