Protein–RNA interactions for Protein: Q78S06

Sys1, Protein SYS1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sys1Q78S06 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Sys1Q78S06 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms